Особая страница истории римской католической общины Запорожья открылась после благословения апостола Святейшего Иоанна Павла II. Настоятель римско-католической общины города Запорожья Ян Собило в апреле 1997 года встречался с Иоанном Павлом II, который передал всему Запорожью свое благословение. А в конце этого же года Ян обратился с просьбой к городской власти о выделении земельного участка под строительство храма. Местные чиновники пошли навстречу настоятелю и решили вопрос положительно.

Епископ Станислав Падевский в Вербное воскресенье, 5 апреля 1998 года освятил землю в центре города Запорожья под строительство храма.

В декабре 1998 года Папой Иоанном Павлом II был освящен краеугольный камень, который взяли в Риме из основания храма Святого апостола Петра. И 7 октября 1999 года, при участии священников и епископов католических, православных и других христианских конфессий, в память Матери Божьей Священного Розария, камень заложили в стену будущего храма Бога Отца. Торжественное богослужение возглавил епископ Леон Дубравский.

В феврале 2000 года отец Ян Собило и епископ Леон Дубравский были приглашены к Иоанну Павлу II на обед. По окончанию обеда, Папой была оставлена под проектом будущего храма Бога Отца Милосердного подпись и дано благословление на его строительство.

7 августа 2004 года торжественно освятили Запорожский храм, и он стал новой достопримечательностью города, гармонично дополняющей его архитектуру.

Храм Бога Отца Милосердного представляет собой западный архитектурный тип церквей – прямоугольное здание, которое внутри разделено рядами столбов и колонн на 3 нефа (нечетное количество продольных частей), которое освещается верхними окнами, и выступающей нишей возле Алтаря. Строгое внутреннее классическое убранство и, вместе с тем, гармония и красота линий. В каждую незначительную часть интерьера вложен труд не одного человека, парафиян, духовенства, спонсоров - благодателей Запорожья.

В этот день здесь собрались со всех концов Украины представители Римско-католической церкви, а также - Италии, Польши, Германии. В Запорожье прибыли пастыри: епископ Симферопольский и Одесский Бронислав Бернацкий, епископ Станислав Широкорадюк Киевско-Житомирской диецезии, епископ - ординарий Леонид Максимилиан Дубравский Каменец-Подольской диецезии, архиепископ Донецкий и Мариупольский УПЦ Киевского патриархата Юрий, епископ Стефан Меньок Донецко-Харьковского экзархата УГПЦ, священники из Германии, Польши, из Италии о. Антонуччи Джиованни и Андреа Д'Асаканио.

На официальной церемонии присутствовали власти Запорожья и Запорожской области, среди которых был А. Панасенко - первый зам. мэра г. Запорожья и В. Стрюк - зам. губернатора Запорожской области, а также - пан Ярослав Ксьонжек, Генеральный консул Республики Польша в Украине.

Праздничное Богослужение и церемонию освящения Алтаря храма Бога Отца Милосердного провел епископ - ординарий Харьковско - Запорожский Станислав Падевский. Во время проповеди, которая была посвящена этому событию, владыка Станислав сказал: «Мы часто воображаем и ощущаем Бога Отца грозного и забываем, что наш Господь – это Отец Милосердный, тот к которому можно прийти со своими проблемами и болью. Пусть этот чудесный храм нашего Отца напоминает нам всегда о том, что мы имеем милосердного и всемогущего Отца».